Csíkvacsárcsi alapításának ideje nem ismeretes. Az elsõ írásos emlék, a Székely Oklevéltár II. Kötetének (1520-tól 1571-ig) a 208-ik, 209-ik, 210-ik oldalán található II. János fejedelmi parancsa, ahol a település Mocharchy néven jelenit meg 1566-ban. Már akkor a fejedelem „tijz haz jobbagioth Feijr Györgynek” adományozott. 1569 körül a Székely Oklevéltár II. kötetében a lófõk összeírásakor már Vachijarchi néven szerepelt a település.
Csíkvacsárcsi az egyedüli falunév, amelynek etimológiáját tisztán nem ismerjük. Számos kutató foglalkozott a falu nevének megfejtésével. Összetett szó, amely a Csík és Vacsárcsi tagokból áll.
A „Vacsárcsi” szó:
- Mocsárcsi (Mocharchy), mocsár szóból ered.
- Vacsárk=vaksár ez is utalás a mocsaras, lápos területre.
- Szõcs János (csíkszeredai muzeológus) szerint eredete hasonlít a Pest megyei Vecsés helység eredetéhez (1318: Wecherch, 1323: Wecherchi, 1345: Vecherch, 1388: Wechech), amely a szláv vecìrz=est szóból ered.
A köztudatban Vacsárcsi nagyon régi eredetû, a legrégibb feljegyzés (egyes tudósok szerint nem hiteles) 888-ból való, Csíki Székely Krónika 9-ik versében található meg Vacsárk néven.